目前治疗纵隔畸胎瘤有效方法以手术为主。一旦诊断了恶性纵隔畸胎瘤，病人应该尽早接受手术，以免肿瘤扩散。 尽管良性肿瘤一般不会发生远处转移，但其引起的症状和并发症较多，手术也同样越早越好。畸胎瘤和所有的肿瘤一样，手术也是率先考虑的治疗手段。这种手术治疗及时治疗性的也同时带有诊断的性质。放化疗对于特定的肿瘤也有一定疗效，但对良性纵隔畸胎瘤效果不佳。
通常情况下，一旦检查出有这种疾病就应该及早实行手术。但是如果肿瘤已经破入心包腔，那么必须实行急诊手术。如果已经出现感染，那么首先必须进行抗感染治疗，但必须争取一切的时间进行手术。如果病人的肿瘤体积十分的大，那么手术前实施麻醉时必须注意病人的血压，以免在麻醉诱导后放置病人体位时，病人的血压可能突然下降。
纵隔畸肿瘤的治疗效果如何？
纵隔畸胎瘤由于本身就有良性和恶性之分，所以两种纵隔畸肿瘤的治疗效果不尽相同。
良性的纵隔畸肿瘤如果在手术中彻底切除的话，一般情况下不会发生转移，也不会复发，在临床治疗后的跟踪随访中结果还是令人满意的。但是相较之下，恶性的畸胎肿瘤的预后效果就不太令人满意。
由于恶性纵隔畸肿瘤发病率较低，国内外有关恶性纵隔畸肿瘤治疗的文献也较少。大多数恶性纵隔畸肿瘤手术治疗后的预后较差。特别是复发后，一般的手术治疗对于恶性的纵隔畸肿瘤基本没有效果。放化疗的手段进行治疗的作用非常局限，其效果只在特定的类型上产生。一般来说，化疗对纵隔肿瘤中的精原细胞瘤有较好的疗效，对其他类型畸胎瘤是没有什么作用的。
那么这种肿瘤就没有医治的方法了吗？其实也不是，最好的方法还是及早发现及早治疗，那么能够根治这种肿瘤也是有可能的，及时治疗手术可以从根本上降低手术的难度，甚至可以在肿瘤恶变之前就解决它。
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