一项对９万日本人所进行的调查表明，每天或几乎每天喝咖啡的人患肝癌的危险是从不喝咖啡的人的一半；每天喝１至２杯咖啡会起到预防肝癌的作用，喝３到４杯会增加其预防作用。
动物实验也表明，咖啡对肝癌有预防作用。为此，位于东京国家癌症中心的一个研究小组进行了１０年的公共健康调查来证明咖啡是否对肝癌有影响。发表在最近出版的日本《国家癌症学会杂志》上的这份研究报告称，在这１０年里，从不喝咖啡或喝咖啡少的人患肝癌的几率为每１０万人中有５４７．２例，而每天喝咖啡的人，每１０万人中只有２１４．６例。
其他研究发现，咖啡中的咖啡因会刺激饮用者的神经，使其清醒。咖啡因也会加重更年期症状或一些抗生素药物的副作用。过量喝咖啡还会导致流产。但研究也表明，在老鼠身上，带有咖啡因的护肤霜可降低患皮肤癌的危险。
温馨提示：咖啡虽然有益健康，但并非人人皆宜。
美国食品及药物管理局（ＦＤＡ）曾发表声明，建议已经怀孕或可能怀孕的妇女减少咖啡因的摄取。咖啡因还会越过胎盘进入胎儿，或是通过母乳的哺育进入婴儿体内，因此，产后数月不要喝咖啡。
有脑血管瘤患者不适合喝咖啡，心脏病患者应喝不含或只含低咖啡因的咖啡，因为咖啡因会增快心跳速度而造成心脏缺氧。
糖尿病患者也要避免喝加入太多糖的咖啡，以免加重病情。
皮肤病患者及有胃病者应尽量少喝咖啡，才不致因过量而导致病情恶化。
“咖啡之道”是适时适量
凡事都应该适时适量，“咖啡之道”也是这个原则。
交感神经受到咖啡刺激、兴奋，食欲会减低。另外，空腹喝咖啡，胃液分泌增加，长期如此，会造成胃溃疡。因此，咖啡宜在餐后饮用。
有些人在晚间饮用了咖啡会失眠，也有些人饮用过多咖啡，也不会受到丝毫影响。因此，对咖啡比较敏感的人，最好不要晚上喝咖啡。
不管餐前餐后，过量饮用咖啡因，都会发生心悸（心脏跳得很厉害），甚至精神恍惚、走路重心不稳等副作用。
一般人每天吸收３００毫克（约３杯煮泡咖啡）的咖啡因，会有好处。但是超过４００毫克（４杯）时，则会带来负面效应，情绪变坏、烦躁，甚至惹人闹事。
因此，咖啡以一天二三杯为佳。
咖啡煮后稳定性下降，煮沸后冷却，成分会发生改变，因此咖啡最佳的饮用温度是８５℃－８８℃。为了减少能量摄入过多，喝咖啡最好不要加糖。
不要过分依赖咖啡提神
许多人喝了咖啡后，都会精神亢奋。值得注意的是，这种咖啡因造成的短暂清醒，并不表示体力真的获得恢复。因此，不要过分依赖咖啡提神，累了时，该休息就要休息。
近年来由于人们对于钙质流失和骨质疏松的问题越来越重视，对于咖啡也产生相当的疑惑。至于咖啡因的摄取和骨质疏松症的关系，仍在持续研究中，目前并没有直接证据显示咖啡因会导致骨质疏松症，但是某些研究则指出咖啡因会增加钙质的流失。在尚无定论的时期，建议咖啡爱好者应该多吃些高钙食品来补充钙质，如准备以奶酪粉做成的吉士片或吉士蛋糕等搭配咖啡享用，不仅能补充钙质，还能使咖啡更加美味。
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